本报讯（记者朱汉斌）克日，华南农业年夜学农学院教学刘耀光、谢先荣团队与配合者开辟了一个基于Sanger测序、二代测序跟三代测序技巧，对种种基因编纂样品的差别范例渐变停止高效检测的剖析东西箱SuperDecode。相干研讨结果宣布于《分子动物》。现在研讨职员对基因编纂资料的渐变范例判定，重要是应用Sanger测序跟二代测序技巧停止检测。为满意科研职员在差别利用场景下的检测沙巴体育投注入口需要，研讨团队开辟了一个片面、综合的基因编纂渐变剖析东西箱SuperDecode，能够对应用差别测序平台发生的数据停止高效剖析，而且优化了基于PCR构建多样本混杂文库的方式。据先容，SuperDecode包括3个子软件模块：DSDecodeMS、HiDecode以及LaDecode，分辨对应Sanger测序、二代测序成果以及三代测序数据的解码剖析。此中，DSDecodeMS是研讨团队此前开辟的网页版东西DSDecode/DSDecodeM的进级当地版，增加了去除Sanger测序两头低品质序列的功效，存在更快的剖析速率、更友爱的应用界面，可经由过程直接读取靶点扩增子的Sanger测序峰图，剖析样本买球的app排行榜前十名推荐的渐变范例。HiDecode能对增加特定barcode序列的多样本混杂文库的二代测序言件停止解码，实现多品种型样本的高通量渐变剖析，包含二倍体、多倍体、细胞系等。HiDecode实践上可一次性检测多达9216个样本的渐变范例。LaDecode则是基于单分子测序技巧，对长片断的PCR扩增子停止高通量解码剖析的软件，可能辨认目标地区中的种种庞杂渐变，并辨别检测样本的全部单倍型。该东西特殊实用于剖析特定地区内多靶点编纂，如启动子地区饱跟渐变跟平铺删除等惹起的庞杂变异。麻将胡了pg下载SuperDecode除了检测由基因编纂发生的渐变外，也能够用于检测天然遗传变异、基因分型等。现在，SuperDecode供给了Windows、MacOS当地化界面版跟Linux下令行版，以及网页版。相干论文信息：https://doi.org/10.1016/j.molp.2025.03.002
